Факультет естественных наук был образован в 2005 году. Готовит специалистов в области химии и химических технологий, биологии и экологии, географии и туризма, охраны окружающей среды и рационального природопользования.

На факультете работает 4 доктора наук, 13 кандидатов наук, 18 докторов философии (PhD). На факультете реализовано более 25 научных и научно-технических проектов, получено более 50 авторских свидетельств и патентов на изобретения, опубликовано более 200 научных статей и 50 монографий.

Факультет сотрудничает с ведущими промышленными, экологическими и туристскими организациями, включая АО «Казахстанский электролизный завод», ТОО «Павлодарский нефтехимический завод», АО «Алюминий Казахстана», Евроазиатскую энергетическую корпорацию, Министерство туризма и спорта Республики Казахстан, Air Astana, Баянаульский государственный национальный природный парк и другими предприятиями.

При факультете функционирует Научно-исследовательский экологический центр «Мониторинг».