Факультет Физики, математики и информационных технологий создан приказом ректора ПГУ имени С. Торайгырова в июне 2003 года. Первым деканом факультета в период 2003-2010 годы был профессор кафедры общей и теоретической физики, доктор физико-математических наук, профессор Тлеукенов Садритен Кабдыгалиевич. В период 2010-2011 учебного года – профессор кафедры информатики и информационных систем, доктор педагогических наук, профессор Нурбекова Жанат Кунапияновна. С 2011 года деканом факультета является профессор кафедры физики и приборостроения, кандидат физико-математических наук, доцент Испулов Нурлыбек Айдаргалиевич.